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  options {
    physical_type: PHYSICAL_STREAM_TYPE_QUADS
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    name: "this"
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    value: "http://www.w3.org/2001/XMLSchema#"
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      name_id: 1
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    value: "hasAssertion"
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rows {
  name {
    value: "assertion"
  }
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    value: "Head"
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  quad {
    s_iri {
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    p_iri {
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    o_iri {
      prefix_id: 7
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    }
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    value: "hasProvenance"
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  name {
    value: "provenance"
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    p_iri {
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    o_iri {
      prefix_id: 7
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    value: "hasPublicationInfo"
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    value: "pubinfo"
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  quad {
    p_iri {
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    o_iri {
      prefix_id: 7
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  prefix {
    value: "http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#"
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    value: "type"
  }
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    value: "Nanopublication"
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    p_iri {
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    value: "http://purl.org/nanopub/temp/"
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    value: "np-889e9c94-2e0e-4f50-a402-dac482c9d14e"
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    value: "Dataset"
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    value: "describesWorkflow"
  }
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  name {
    value: "RAOBjU_aTRgW5zb2MFGvZPAXBZegQRzVoUU-aSGQFpxh4"
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    p_iri {
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    }
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    }
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    value: "generatedAt"
  }
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  datatype {
    value: "http://www.w3.org/2001/XMLSchema#dateTime"
  }
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rows {
  quad {
    p_iri {
      prefix_id: 3
    }
    o_literal {
      lex: "2026-03-13T14:56:00.669700+00:00"
      datatype: 1
    }
  }
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    value: "hasSummary"
  }
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  name {
    value: "ws-c46fa39d-d42f-46db-8fc6-75465b9e741b"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_iri {
      prefix_id: 11
    }
  }
}
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  name {
    value: "hasWorkflowRun"
  }
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  name {
    value: "wr-e0de72f5-baad-4a8a-bc68-e38b12a47dd8"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      prefix_id: 3
    }
    o_iri {
      prefix_id: 11
    }
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  name {
    value: "param-bwa_mem-1"
  }
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  name {
    value: "Parameterization"
  }
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rows {
  quad {
    s_iri {
    }
    p_iri {
      prefix_id: 10
      name_id: 10
    }
    o_iri {
      prefix_id: 3
      name_id: 22
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "parameterIndex"
  }
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  datatype {
    value: "http://www.w3.org/2001/XMLSchema#integer"
  }
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rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "1"
      datatype: 2
    }
  }
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rows {
  name {
    value: "parameterValue"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "-R \'@RG\\tID:{sample}\\tSM:{sample}\'"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "param-bwa_mem-2"
  }
}
rows {
  quad {
    s_iri {
      prefix_id: 11
    }
    p_iri {
      prefix_id: 10
      name_id: 10
    }
    o_iri {
      prefix_id: 3
      name_id: 22
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "2"
      datatype: 2
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "samtools"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "param-bwa_mem-3"
  }
}
rows {
  quad {
    s_iri {
      prefix_id: 11
      name_id: 26
    }
    p_iri {
      prefix_id: 10
      name_id: 10
    }
    o_iri {
      prefix_id: 3
      name_id: 22
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "3"
      datatype: 2
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "coordinate"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "param-bwa_mem-4"
  }
}
rows {
  quad {
    s_iri {
      prefix_id: 11
      name_id: 27
    }
    p_iri {
      prefix_id: 10
      name_id: 10
    }
    o_iri {
      prefix_id: 3
      name_id: 22
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "4"
      datatype: 2
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "param-samtools_index-1"
  }
}
rows {
  quad {
    s_iri {
      prefix_id: 11
      name_id: 28
    }
    p_iri {
      prefix_id: 10
      name_id: 10
    }
    o_iri {
      prefix_id: 3
      name_id: 22
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "1"
      datatype: 2
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "rule-all"
  }
}
rows {
  name {
    value: "WorkflowRule"
  }
}
rows {
  quad {
    s_iri {
      prefix_id: 11
      name_id: 29
    }
    p_iri {
      prefix_id: 10
      name_id: 10
    }
    o_iri {
      prefix_id: 3
      name_id: 30
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "hasSoftwarePackage"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "all"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "ruleName"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "rule-bcftools_call"
  }
}
rows {
  quad {
    s_iri {
      prefix_id: 11
    }
    p_iri {
      prefix_id: 10
      name_id: 10
    }
    o_iri {
      prefix_id: 3
      name_id: 30
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "hasOutput"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 34
    }
    o_literal {
      lex: "calls/all.vcf"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 31
    }
    o_literal {
      lex: "envs/bcftools.yml"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "shell"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "bcftools_call"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "rule-bwa_mem"
  }
}
rows {
  quad {
    s_iri {
      prefix_id: 11
      name_id: 35
    }
    p_iri {
      prefix_id: 10
      name_id: 10
    }
    o_iri {
      prefix_id: 3
      name_id: 30
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 34
    }
    o_literal {
      lex: "sorted_reads/A.bam"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "sorted_reads/B.bam"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "sorted_reads/{sample}.bam"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "hasParameterization"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 36
    }
    o_iri {
      prefix_id: 11
      name_id: 21
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_iri {
      name_id: 25
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_iri {
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_iri {
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      prefix_id: 3
      name_id: 31
    }
    o_literal {
      lex: "envs/bwa.yml"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "v8.1.1/bio/bwa/mem"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "parametersJSON"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 37
    }
    o_literal {
      lex: "[\"-R \'@RG\\\\tID:{sample}\\\\tSM:{sample}\'\", \"samtools\", \"coordinate\", \"\"]"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 32
    }
    o_literal {
      lex: "bwa_mem"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "rule-plot_positions"
  }
}
rows {
  quad {
    s_iri {
      prefix_id: 11
      name_id: 38
    }
    p_iri {
      prefix_id: 10
      name_id: 10
    }
    o_iri {
      prefix_id: 3
      name_id: 30
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 34
    }
    o_literal {
      lex: "calls/positions.png"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 31
    }
    o_literal {
      lex: "envs/matplotlib.yml"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "scripts/plot-positions.py"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "plot_positions"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "rule-plot_quals"
  }
}
rows {
  quad {
    s_iri {
      prefix_id: 11
      name_id: 39
    }
    p_iri {
      prefix_id: 10
      name_id: 10
    }
    o_iri {
      prefix_id: 3
      name_id: 30
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 34
    }
    o_literal {
      lex: "calls/quals.png"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 31
    }
    o_literal {
      lex: "envs/matplotlib.yml"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "scripts/plot-quals.py"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "plot_quals"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "rule-samtools_index"
  }
}
rows {
  quad {
    s_iri {
      prefix_id: 11
      name_id: 40
    }
    p_iri {
      prefix_id: 10
      name_id: 10
    }
    o_iri {
      prefix_id: 3
      name_id: 30
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 34
    }
    o_literal {
      lex: "sorted_reads/A.bam.bai"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "sorted_reads/B.bam.bai"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "sorted_reads/{sample}.bam.bai"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 36
    }
    o_iri {
      prefix_id: 11
      name_id: 28
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      prefix_id: 3
      name_id: 31
    }
    o_literal {
      lex: "envs/samtools.yml"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "v5.7.0/bio/samtools/index"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 37
    }
    o_literal {
      lex: "[\"\"]"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      name_id: 32
    }
    o_literal {
      lex: "samtools_index"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "WorkflowRun"
  }
}
rows {
  quad {
    s_iri {
      prefix_id: 11
      name_id: 20
    }
    p_iri {
      prefix_id: 10
      name_id: 10
    }
    o_iri {
      prefix_id: 3
      name_id: 41
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "configJSON"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "{\"samples\": {\"A\": \"data/samples/A.fastq\", \"B\": \"data/samples/B.fastq\"}}"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "configfile"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "config/config.yaml"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "dagSource"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "Snakefile"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "config/config.yaml"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "envs/bcftools.yml"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "envs/bwa.yml"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "envs/matplotlib.yml"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "envs/samtools.yml"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "scripts/plot-positions.py"
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_literal {
      lex: "scripts/plot-quals.py"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "description"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "hasRule"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_iri {
      prefix_id: 11
      name_id: 29
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_iri {
      name_id: 33
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_iri {
      name_id: 35
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_iri {
      name_id: 38
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_iri {
    }
  }
}
rows {
  quad {
    o_iri {
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "includedSnakefile"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      prefix_id: 3
      name_id: 47
    }
    o_literal {
      lex: "/home/meesters/Documents/Teaching/snakemake-hpc-teaching-material/snakemake-tutorial/Snakefile"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "mainSnakefile"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "workflowMetadataJSON"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "{}"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "WorkflowSummary"
  }
}
rows {
  quad {
    s_iri {
      prefix_id: 11
      name_id: 18
    }
    p_iri {
      prefix_id: 10
      name_id: 10
    }
    o_iri {
      prefix_id: 3
      name_id: 50
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "numberOfJobs"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "8"
      datatype: 2
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "numberOfResults"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "2"
      datatype: 2
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "numberOfRules"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "6"
      datatype: 2
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "generatedAtTime"
  }
}
rows {
  quad {
    s_iri {
      prefix_id: 7
      name_id: 4
    }
    p_iri {
      prefix_id: 5
      name_id: 54
    }
    o_literal {
      lex: "2026-03-13T15:56:00.698781"
      datatype: 1
    }
    g_iri {
      prefix_id: 7
      name_id: 7
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "wasAttributedTo"
  }
}
rows {
  name {
    value: "0000-0003-2408-7588"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      prefix_id: 5
      name_id: 55
    }
    o_iri {
      prefix_id: 4
    }
  }
}
rows {
  quad {
    s_iri {
      prefix_id: 8
      name_id: 2
    }
    p_iri {
      prefix_id: 5
      name_id: 54
    }
    o_literal {
      lex: "2026-03-13T15:56:00.698781"
      datatype: 1
    }
    g_iri {
      prefix_id: 7
      name_id: 9
    }
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      prefix_id: 5
      name_id: 55
    }
    o_iri {
      prefix_id: 4
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "sig"
  }
}
rows {
  name {
    value: "hasAlgorithm"
  }
}
rows {
  quad {
    s_iri {
      prefix_id: 7
    }
    p_iri {
      prefix_id: 2
    }
    o_literal {
      lex: "RSA"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "hasPublicKey"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "MIIBIjANBgkqhkiG9w0BAQEFAAOCAQ8AMIIBCgKCAQEAkOFUnnRCp/k9/0ugvx8zQJ+Qc675W1Ug6F839+xvJ2QsSBu4iOJ1O2kJCmb3tALp3gJOt8sffRot3VrfY1hbgXxL7BVtDsfHHmXVff4YCeg5Ycdn5cDpLawDpAdYwMhK0LwIkZ3fwH9/o9JniYKXLV/jpF9bMKyiw/6tqlCHaMW1r8gzZzoxVIAakwvlABoY0iNoToLTlBRXEI4mLUNjDMnMwQgfh1KXMxMruNjW3wJyeDEIfa2ooAt0E4CRM9pkrEb37NzD9Jz8aSUFFY6BvIxF4ixK7rm6IUDvQ76LqXkEmgSeRv1kw7gnCe9wV/wHd0ZeW4heoBXmLHX3MvHfjwIDAQAB"
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "hasSignature"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_literal {
      lex: "XLpj3h5lBHdnR7H5dBpBYMFlqD6e4MC4e1sfDW4JjeO7uOq3xR4JIvhM9M5yFoLJrxEdoczvEdeUYKZg2TtLGLr1DoPXnF6W+mXIL8QkX0XrxykP1ZHAag33IqtqqDXDnul1oWgxBOShmVo+Cze9TVrBb50dvPKYg6Yc/WjXAxqTyJBlPvzN5KOYv49PaEblNp+xCX7S+ALkIaPkiy+atp+a1oUgcT5z9hizwEiTto/24WG7qW90mGxS3nNj3wSr7DC8GCMQ1mO/cP+VRO1bk1OqThtyTwTjYnj0QnjTTwkjgoDlFgNUpwkVXTCpi8NqfcN8L9eGQy2drGjgh1N4qQ=="
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "hasSignatureTarget"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
    }
    o_iri {
      prefix_id: 8
      name_id: 2
    }
  }
}
rows {
  name {
    value: "signedBy"
  }
}
rows {
  quad {
    p_iri {
      prefix_id: 2
      name_id: 62
    }
    o_iri {
      prefix_id: 4
      name_id: 56
    }
  }
}